Решений по-моему скромному мнению два. 1й вариант. Если в секторе больше не будете появляться просто присоедините их в комплексе и не тратьте времени постройка комплексов. 2й вариант. Методом 3000 в нужном секторе закидываем корабль с транспортером и стыковочным компьютером (или если на своём корабле есть), там его и оставляем. Заходим в сектор через врата, перемещаемся в закинутый корабль, стыкуемся к нужной станции, взрываем станцию, повторять до тех пор пока не будут уничтожены все не нужные вам станции. (Нечто похожее можно провернуть со своим прыжковым маяком).