Во-первых, нужно будет редактировать модель ДО, добавляя в нее "разъемы" для стыковочных узлов. А во-вторых, в комплексах используется свой головной модуль, который абсолютно не волнует, какие типы кораблей могут стыковаться к станциям, входящим в состав комплексов. Их собственные стыковочные узлы после присоединения к комплексу не используются...
Так что, фэйл. Для возможности стыковки с комплексом надо не вводить в его состав ДО, а редактировать конструкцию головного модуля (стыковочного узла комплексов).
Ну заменить я думаю было бы тоже не плохо, бонус в виде пары мест для капшипов многим бы понравился.