х3tсupdate1.0.1_to_2.5, потом x3tcupdate2.0_to_3.0
Первый патч - кумулятивный. Ставится на любую версию и апдейтит игру до версии 2.5. Второй - предназначен для установки на версию 2.0. А ты накатил его на 2.5.
Снеси игру полностью. Потом вручную удали папки (анинсталл автоматически удаляет не все). Потом установи заново и пропатч нормально.
После этого можешь начать новую игру и поиграть без тормозов. Или поставить ТОТТ и играть с тормозами, но сюда об этом не пиши.