Короче говоря, многие последствия установленных скриптов/модов хранятся в игровых сэйвах. Если что-то не состыковалось с оригинальными патчами, просто удалить скрипты и моды может оказаться недостаточным, т.к. эти последки в сэйвах останутся. И тогда придется все равно начать новую игру.