СУВ будет отключаться при атаке на корабль, запуске ракеты, докладе подчиненного и т.д. В чистой игре сделать с этим ничего нельзя.
Но постарайтесь сделать так, чтобы менеджеры не лезли со своими докладами. Дайте им денег.
P.S. Надо сказать, что разрабы не очень одобряют практику безнадзорного "сидения на СУВе". В третьих иксах, к примеру, была фишка: каждый определенный промежуток времени, проведенный на СУВ без хотя бы однократного нажатия кнопок, на определенную величину снижался боевой рейтинг игрока.