...почему не могу отправить на Пополнение запаса корабля абордажными капсулами корабль? ...
Значит их нет в продаже в радиусе запуска снабженца. Радиус - 10 прыжков. Пробуй стартовать из другого сектора. После удачного запуска снабженец будет собирать заказ по всей вселенной, но для старта товар должен быть в наличии в пределах 10 секторов.