Тормоза сильные начались после того как, по прохождению Земной сюжетки мне пришлось перевозить пассажиров (Хейвуд) и (Пирли) в( Край еретиков).
Очень похоже на баг одной из ранних версий игры (давно закрыт официальными патчами), где была проблема с утечкой памяти в модуле управления миссиями. В конечном итоге это гарантированно приводило к сильному падению FPS просто по факту налёта определённого количества часов.
Вероятно, один из модов заменил пропатченные файлы на старые. Или же сам внёс в игру похожий баг.