Может быть, нужно продолжать крошить остатки астероида до пыли, а потом запускать шахтёра!?
Нет. После этого к куче обломков надо подогнать корабль с трюмом размера XL и отдать команду "Сбор астероидов в секторе". Команду можно найти в меню "специальные". В итоге корабль будет тупо собирать куски раскрошенного астероида как контейнеры. Дабы ускорить это процесс - покиньте сектор. Других способов автоматизации добычи нивидиума нет.
К сожалению не помню что за модули нужны для работы этой команды, но полагаю что сканера минералов и специального модуля СПМ -1 хватит.
