Вариант №1: -в настройках КА можно поменять цифры, до какого % заполнять склад. Не знаю только, чем именно считаются баты на складе ШК - ресурсом? промежуточным продуктом? пробуй менять все подряд...
Вариант №2: -в бонус-паке есть (должен быть) Менеджер товаров - копайся в командах самой станции, найди там возможность ограничить размеры склада под конкретные товары. То есть склад ШК =500 000, но под батареи выдели, скажем, 15 000. Тогда КА будет считать, что 15 000 батарей - это полный склад, и не привезет больше этого количества.