можно их как-то уничтожить или есть генИальные идеи быстро их сократить?
Гениальных идей - это вряд ли. Это надо ставить всевозможные модули на корабли классов от М5 до TS и искать в Специальном меню команду "Собрать развернутое оборудование". Честно скажу - не помню про нее подробностей. Не помню даже, из оригинальной игры эта команда или из бонус-пака. Видел ее в прежних играх серии, вот и вспомнилась.
Башни кучно висят? Можно построить какую-нибудь гигантскую станцию и потаскать ее на буксире по этим башням. Можно высыпать в кучу башен сопоставимую с ней кучу мин, а потом рвануть их все разом к такой-то бабушке.