Я не уверен на 100% насчет War Pack - лично у меня Супербокс. Но раз уж в Супербоксе все игры идут отдельно - полагаю, что и в Варпаке точно так же. Тогда какие проблемы? Если АР уже был установлен - сносим все. Потом устанавливаем ТОЛЬКО Земной конфликт. И никаких проблем. Если же АР вообще не устанавливался - то и сносить ничего не надо.
Не совсем отдельно. Там есть определенные тонкости, связанные непосредственно со Steam'ом. У меня есть и старая добрая коробка ТС и War Pack TC+AP. Что нормально идет на коробочной версии, на другой имеет кучу багов. Хотя подавляющее большинство файлов должно быть идентичным (за исключением озвучки). АР по своей сути надстройка для ТС, использующая значительное число ресурсов оригинала. И в этих общих ресурсах похоже что-то подкрутили...