Угробив в пустую на лишних перезагрузках несколько часов, просто перестал брать несколько миссий подряд (сюжетки не в счёт...) и всё пошло нормально...
Когда маяк рождается слишком близко к астеру или еще чему-то, можно станцию намеренно поставить чуть в стороне, а потом подтащить гравилучом поближе к маяку.