Вроде не обязательно начинать новую игру. Игра может сначала и не скушает изменения но после нескольки загрузок должна проглотить
Игра загрузится и даже будет работать, но вот все изменения характеристик кораблей повлияют только на вновь создаваемых неписей (поскольку они не умеют тюнинговать свои корабли). А вообще, увеличение скорости кораблей без подгонки остальных характеристик - далеко не лучшая идея, ибо количество камикадзе при нахождении игрока в секторе серьезно увеличится.