Через Jobs - никак (по крайней мере, при редактировании через X3Editor).
Могу посоветовать глянуть скрипты Phanon Corporation и Revelations от Litcube - там как раз реализованы враждебные всем корабли.
Как реализовать боевые группы враждебной расы через MD - можно посмотреть в скрипте сюжета "Грязные делишки", это наемники корпораций и боевая группа яки (ксеноны созданы через специальные Jobs).
Имеются в виду ксеноны в Сегарисе и Черном солнце (jobs с 2125 по 2133). Те, что обретаются на ксенонском кладбище, созданы вручную.
