А Вы уже хоть раз проходили эту миссию ? Проблемы были ? Если нет попробуйте загрузить более старое сохранение или в крайнем случае переустановите игру (естественно это крайняя мера если не помогла загрузка самых старых сохранений то скорее всего старт новой игры тоже будеет безполезен) Проходил её (миссию) всего 2 раза: 1) На Акило меня "попросили" уничтожить Корвет и Истребитель. 2) На Гиперионе только Корвет.
ПС: Вообще лично мне антихаакская ветка кроме доступа в Аргонский сектор М148 и повышения самооценки ничего интересного не принесла. Но то - я. А Вам могу посоветовать попробовать начать прохождение других веток и если появятся проблемы то переустановка и прокачивание до самой последней версии в помощч.
