Выходит есть скрипт, отвечающий за изменение отношения на дружественное при интенсивном обстреле или это был глюк?
Нет. Просто, есть случаи, при которых непись пересматривает своё отношение к игроку. Родился с отрицательным, а общий пиратский рейтинг положительный. Если произошёл пересмотр - отношение изменилось. Такое же бывает при сканировании.