Я тоже не вижу смысла в переименовании кораблей, разве что номера иногда приписываю; кортик-1, кортик-2, чтоб не перепутать при обмене грузами, а комплексы тоже по такому же принципу.
Я в принципе делаю также,только М1 и М2 даю имена.А чтобы не путать корабли по классам М1 даю названия городов или допустим рек,а М2 названия гор или как нибудь еще,чтобы что-нибудь общее было.