Строю допустим кремниевую шахту потом рядом солнечную станцию, далее в транспорте выбираю груз--- стыковочный узел--- ПОСТРОИТЬ. Вот при нажатии "построить" всплывает карта сектора где справа должен быть список станций для стыковки. Там нет ни одной станции.
Выбери командную консоль своего TL'а. Команды > Специальные > Построить станцию, выбери из списка стыковочный узел и нажми Enter.
Это только предположение. Вообще должно работать и так, и этак. Если не получается - выложи на какой-нибудь файлообменник сейв с двумя построенными станциями, которые не хотят соединяться. Посмотрим, соединятся ли они у нас...
Если соединятся, значит у тебя что-то с игрой и трэба переустановить. Сейвы не пропадут.