Входить во врата с прицепленной яхтой нужно как обычно, можно без автопилота. Когда появитесь в следующем секторе, не трогайте управление кораблем. Он сам наберёт скорость до максимума, отлетит на безопасное расстояние и остановится. Яхта появится во вратах через несколько секунд и самостоятельно займёт нужную позицию. Когда снова появится силовой луч (он появится сам, повторно цеплять яхту не нужно), тогда можно будет продолжить свой путь к верфи.
Цитата к прохождению миссии от корпорации БалаГи из Х3R, но в ТС всё работает точно так же (только заменить слово "яхта" на "космобаза ...") .
. 
